És el moment de conèixer la història de Sidonia. Per què hi havia únicament 28 Habizashi, l'única arma capaç de destruir el nucli dels Gauna? Per què la capitana va decidir confiar el Tsugumori a Nagata Per què les Gaunas ataquen al Sidonia? El passat de Sidonia es connecta amb el jou de la destinació de Nagate.