«Sóc un expert espadachín i tinc una gran habilitat en el maneig de la mort. No és una habilitat que m'aporti plaure però se'm dóna bé, simplement». Haytham Kenway ha après a manejar l'espasa des que era un nen i va ser capaç de sostenir el pes de l'arma. Quan la seva llar sofreix un terrorífic atac en el qual el seu pare és assassinat i la seva germana segrestada, Haytham es veu obligat a defensar als seus de l'única manera que sap: matant. Un misteriós tutor es fa càrrec d'ell i li ensenya a convertir-se en un assassí letal. Consumit per la set de venjança, Haytham inicia la recerca que li porti fins a aquells que van acabar amb la seva família, sense confiar en ningú, posant en dubte tot allò que va aprendre i va conèixer de nen. La conspiració i la traïció li emboliquen mentre se submergeix més i més en la llarga batalla entre Assassins i Templarios, una batalla que es remunta al principi dels temps.